Supponiamo che abbiate un file di dati mydata.txt. Il file deve contenere solo numeri (ad esempio su due colonne per un grafico x,y) oppure stringhe che comincino con il carattere # (che sono ignorate da gnuplot). Prima fate il grafico che vi interessa:

gnuplot> set title 'Il mio grafico'
gnuplot> set xlabel 't (s)'
gnuplot> set ylabel 'h (m)'
gnuplot> plot 'mydata.txt'

Quando siete sicuri che tutto e' a posto date i comandi

gnuplot> set terminal png
gnuplot> set output 'mydata.png'
gnuplot> plot 'mydata.txt'
gnuplot> quit

Il comando set terminal png indica a gnuplot di non mandare l'output su standard output, ma su un file di tipo png. Usate il comando help set terminal per informazioni su altri tipi di output. Con set output 'mydata.png' diciamo a gnuplot di usare il file di nome mydata.png come output. Al successivo comando plot non vedremo nulla sullo schermo perché l'output andrà sul file.